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SoSe19

19403413: Projektmanagement im Softwarebereich - OpenMS (Softwarepraktikum)
In diesem Praktikum werden Algorithmen für die Qualitätskontrolle zur Analyse von Massenspektrometrie Daten mit Hilfe der Software-Bibliothek OpenMS implementiert. Mithilfe der zu implementierenden C++ Module werden Qualitätsmetriken in bestehenden komplexen Analyse-Pipelines für Proteomdaten gesammelt. Der Fokus liegt auf der Entwicklung effizienter Algorithmen und deren Schnittstellen zu ...
InstructorChris Bielow
Registration Die Praktikumsplätze werden über ein besonderes Anmeldeverfahren vergeben. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Webseite des Studienbüros zum Softwarepraktikum.
19404313: Projektmanagement im Softwarebereich - Workflows (Softwarepraktikum)
In diesem Praktikum werden Workflows für die Analyse von biologischen Daten konzeptioniert und implementiert. Die Teilnehmer werden dabei verschiedene Workflowsysteme (KNIME, Galaxy, Snakemake) kennenlernen und verwenden. Die Teilnehmer werden dabei anhand aktueller Literatur ihre Workflows eigenständig erarbeiten, testen und verfeinern. Dabei werden sowohl Kenntnisse im Rahmen der Workflow ...
InstructorSandro Andreotti
Registration Die Praktikumsplätze werden über ein besonderes Anmeldeverfahren vergeben. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Webseite des Studienbüros zum Softwarepraktikum.
19404511: Introduction to Computational Proteomics (Seminar)
This seminar will cover central aspects of modern bottom-up proteome analysis by mass spectrometry with a focus on bioinformatic algorithms and data analysis. Covered topics will include isotope model calculation, identification of mass spectra, false-discovery-rate estimation using decoy peptides, absolute and relative quantification of proteins and correlation between mRNA and protein ...
InstructorChris Bielow
TimeApr 12, 2019 - Jul 12, 2019
Seminar, immer Freitags, 12:00 - 14:00 Uhr